凈化工作臺可以根據氣流的方向，劃分為垂直工作臺和水平流工作臺，垂直流工作臺能夠在頂部，噪音較大的情況下，垂直凈化工作臺運用在醫藥工程中，垂直流能夠保護身體健康，水平流噪音較好，風向向外，多用在電子行業中。

水平層的凈化工作臺，是一種通用性超強的潔凈工作臺，被廣泛的用在精密儀器，電子，G防，制藥行業以及儀表等。

垂直層流凈化工作臺，垂直單向凈化工作臺被廣泛的用在局部潔凈區域，生物制藥，實驗室，微電子，光電產業以及硬盤制造等*域。

潔凈工作臺水平送風，以及垂直送風都能夠滿足不同的實驗要求。需要考慮的是氣流型，一般使用垂直型，垂直型送風也就是垂直向下送風，準閉臺式臺面能夠有效的防止滲漏以及操作異味對人體的刺激。如果將工作臺放在顯微鏡下，垂直送風的氣流阻擋，這種情況可以選擇水平風，不過一般實驗使用垂直型，玻璃門上下移動，總體來講，水平和垂直風不存在著任何優劣之分，根據不同的實驗要求選擇合適類型。超凈工作臺對設備的清潔工作要求很嚴格，清潔包含例行清潔和定期熏蒸清潔處理，能夠及時將縫隙內的贓物清理干凈。清潔包含使用前后例行清潔，進行熏蒸之時，要對凈化工作臺完全密封，比如操作口的可移動擋板，能夠更好的利用。