凈化工作臺的放置位置將取決于工作流進入，超凈工作臺的內部，內部以及外部，以及工作流將如何與其他操作交互。此外，超凈工作臺的位置應遠離明顯的氣流，以及風速將超過每分鐘100英尺（從HEPA過濾器出來的氣流速度相同）的區域。如果外部空氣直接吹向超凈工作臺，它將吹入設備并污染空間。HEPA過濾器周圍應有負壓，并且HEPA過濾器的位置應與將來的維??修需求兼容。應考慮可能影響將長凳帶入空間的任何物理限制，例如門，走廊和其他設備。
潔凈室工作臺可在潔凈室或其他潔凈空間內使用。100,000級（ISO 8）或10,000級（ISO 7）潔凈室可包括凈化工作臺，以創建100級（ISO 5）甚至10級（ISO 4）區域。干凈的工作臺可以使周圍的環境保持清潔。HEPA過濾器處理的顆粒污染物明顯減少，威脅進入工作區域的環境污染物也更少。